สืบค้นงานวิจัย
การแสดงออกของยีน choline monooxygenase (cmo) ในปาล์มน้ำมัน
พจมาลย์ สุรนิลพงศ์, สุวิทย์ วุฒิสุทธิเมธาวี - มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์
ชื่อเรื่อง: การแสดงออกของยีน choline monooxygenase (cmo) ในปาล์มน้ำมัน
ชื่อเรื่อง (EN): The expression of choline monooxygenase (cmo) in oil palm
ผู้ร่วมงาน / ผู้ร่วมวิจัย:
  1. พจมาลย์ สุรนิลพงศ์
  2. สุวิทย์ วุฒิสุทธิเมธาวี
คำสำคัญ:
  1. ปาล์มน้ำมัน
  2. ยีนทนแล้ง
  3. ยีน
คำสำคัญ (EN): cmo
บทคัดย่อ: น้ำเป็นปัจจัยที่สำคัญที่สุดที่มีผลต่อการให้ผลผลิตของปาล์มน้ำมัน ยีน choline monooxygenase (CMO) เป็นยีนที่อยู่ในกลุ่ม compatible organic solution เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์สาร glycine betaine ซึ่งเป็นสารที่พืชสร้างขึ้นเพื่อตอบสนองต่อความเครียดที่มีสาเหตุมาจากความแห้งแล้ง ดังนั้นในการศึกษานี้ผู้วิจัยได้ทำการหา Full length ของยีน CMO ในปาล์มน้ำมันสายพันธุ์สุราษฎร์ธานี 2 และศึกษาการแสดงออกของยีน CMO ในปาล์มน้ำมันสายพันธุ์ต่างๆ ซึ่งในเบื้องต้นในทำการศึกษาการเจริญเติบโตของปาล์มน้ำมันในสภาวะให้น้ำและงดให้น้ำ โดยทำการปลูกปาล์มน้ำมันสายพันธุ์การค้าอายุ 11 เดือน จำนวน 10 สายพันธุ์ ได้แก่ สายพันธุ์สุราษฎร์ธานี 2 ทรัพย์ มอ.1 Golden Tenera หนองเป็ด Univanich CPI Hybrid Nigeria Black Ghana DLM Advance และ DIY Millennium ภายใต้สภาวะจำลองการให้น้ำและงดให้น้ำเป็นเวลา 0 15 30 และ 45 วัน เพื่อศึกษาการตอบสนองทางสรีรวิทยา และเพื่อเก็บตัวอย่างใบ ผลการศึกษาการตอบสนองทางสรีรวิทยาของปาล์มน้ำมันต่อสภาวะงดให้น้ำแสดงให้เห็นว่า ปาล์มน้ำมันแต่ละสายพันธุ์แสดงลักษณะทางสัณฐานและสีรวิทยาแตกต่างกัน ปาล์มน้ำมันทุกสายพันธุ์มีรัศมีทรงพุ่ม พื้นที่ใบ อัตราการคลี่บานของใบอ่อน จำนวนปากใบ ขนาดปากใบ ขนาดเซลล์คุม ขนาดเซลล์- บัลลิฟอร์ม ปริมาณคลอโรฟิลล์ ปริมาณแป้งและน้ำตาล ลดลงตามระยะเวลาการขาดน้ำที่เพิ่มขึ้น ซึ่งผลที่ได้นี้ไม่สามารถจำแนกความดีเด่นของสายพันธุ์ต่อสภาพขาดน้ำได้ได้อย่างชัดเจน ส่วนผลการศึกษาการแสดงออกของยีน CMO ในต้นปาล์มน้ำมันสายพันธุ์ต่างๆ พบว่า หลังงดให้น้ำ 15 และ 30 วัน ปาล์มน้ำมันสายพันธุ์สุราษฎร์ธานี 2 มีปริมาณการแสดงออกของยีน CMO สูงที่สุด เท่ากับ 0.827 และ 0.397 เท่า ตามลำดับ และเมื่องดให้น้ำเป็นเวลา 45 วัน ปริมาณการแสดงออกของยีน CMO ในปาล์มน้ำมันลดลงทุกสายพันธุ์ แต่ปาล์มน้ำมันสายพันธุ์สุราษฎร์ธานี 2 ก็ยังคงมีการแสดงออกของยีน CMO มากที่สุดคือ -0.303 เท่า ผลการศึกษานี้แสดงให้เห็นว่า ปาล์มน้ำมัน สายพันธุ์สุราษฎร์ธานี 2 ตอบสนองต่อการทนแล้งได้ดีที่สุด เมื่อตรวจสอบการแสดงออกของยีน CMO ดังนั้นสามารถพัฒนายีน CMO ให้เป็นเครื่องหมายโมเลกุลเพื่อตรวจสอบลักษณะทนแล้งในปาล์มน้ำมันได้ ในส่วนของผลการหา Full length ด้านปลาย3’ ได้นิวคลีโอไทด์ขนาด 1,148 bp ที่มีความคล้ายคลึงกับยีน CMO ของปาล์มน้ำมันและอินทผาลัม และพบตำแหน่ง domain 2 ตำแหน่ง ที่บ่งบอกว่า ลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ได้เป็นลำดับเบสที่สมบูรณ์และเป็นส่วนหนึ่งของยีน CMO คือ RHO_alpha_C_CMO-like และ Ring_hydroxyl_A ส่วนด้านปลาย 5’ พบลำดับนิวคลีโอไทด์ของ ขนาด 838 คู่เบส ที่มีลำดับเบส AGT เป็น start codon และ ลำดับนิวคลีโอไทด์ 1,308 bp ที่มีรหัสหยุดเป็น TAA และพบตำแหน่ง domain 7 ตำแหน่ง ที่บ่งบอกว่าลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ได้จากการค้นหาเป็นลำดับเบสที่สมบูรณ์และเป็นส่วนหนึ่งของยีน CMO คือ Rieske_RO_Alpha_CMO, RHO_alpha_C_CMO-like, Rieske, HcaE, anthran_1_2_A, PLN00095 และ DUF260 และเมื่อทำการศึกษา Phylogenetic tree ของลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้งหมดของยีน CMO กับพืชชนิดอื่นๆ พบว่า ยีน CMO ของปาล์มน้ำมันสายพันธุ์ราษฎร์ธานี 2 อยู่ในกลุ่มเดียวกับอินทผาลัม ข้าวบาร์เลย์ ข้าวกลุ่ม Japonica และ กล้วยป่า ซึ่งเมื่อทำการเปรียบเทียบความคล้ายคลึงกันของกรดอะมิโนในยีน CMO กับพืชอื่นๆ พบว่า มีความคล้ายคลึงกับปาล์มน้ำมันในฐานข้อมูล NCBI มากที่สุด โดยสรุปการศึกษานี้พบ Full length ของยีน CMO จากปาล์มน้ำมันสายพันธุ์ราษฎร์ธานี 2 มีลำดับเบสที่แตกต่างจากฐานข้อมูล NCBI และ Malaysia oil palm ทั้งนี้พบบริเวณที่แตกต่างในส่วนปลายของการแปลรหัส ซึ่งเป็นส่วนที่ไม่มีตำแหน่ง domain เท่านั้น ซึ่งลำดับเบส full length ของยีน CMO ที่พบนี้จะ upload เข้าสู่ฐานข้อมูล NCBI หลังจากส่งผลงานตีพิมพ์ คำสำคัญ: ไกลซีน เบนเทรน ลำดับเบสเต็มยีน วงศ์วานวิวัฒนาการ
บทคัดย่อ (EN): Water is a main factor affecting oil palm production. Choline monooxygenase (CMO) is a gene in compatible organic solution group associated with glycine betaine synthesis that Plants producing for response of drought stress. The aim of this study was to identify the full length of CMO gene in oil palm variety Suratthani 2 and examine the expression of CMO gene in several of oil palm varieties under water deficition. Basically, growth of oil palm under well watering and non watering were study. Eleven-months old of 10 oil palm commercial varieties; Suratthani 2, PSU1, Golden Tenera, Nong Ped, Univanich, CPI Hybrid, Nigeria Black, Ghana, DLM Advance and DIY Millennium, were grew under controlled condition and submitted to water deficit for 0, 15, 30 and 45 days for the study on the physiological responded and for leaf collected. The result of physiological response to water deficit in oil palm revealed the difference morphologies and physiologies among oil palm varieties. All of oil palm varieties showed radius canopy, leaf area, leaf expansion rate, stomata number, stomata size, guard call size, cell bulliform size, chlorophyll content, starch content and sugar content decreased following an increasing of the water deficition times. However, this result obtained was not clearly identified for dehydrated outstanding variety. Expression result of CMO gene in various oil palm varieties after dehydrated 15 and 30 days revealed that oil palm variety Suratthani 2 showed the highest expression fold of CMO gene as 0.827 and 0.397, respectively. At the dehydrated of 45 days, the expression of all oil palm varieties decreased, but oil palm variety Suratthani 2 still showed the highest expression fold of CMO gene as -0.303. The result of a full length at the 3’ region has a nucleotide sequence as 1,148 bp that was similar to the CMO gene from oil palm and date palm. Also, 2 domain positions indicated the complete nucleotide sequence and are the part of the CMO gene naming, RHO_alpha_C_CMO-like and Ring_hydroxyl_A, was found. at the 5’ region, nucleotide sequence as 838 bp with AGT stat codon and nucleotide sequence as 1,308 bp with the TAA stop codon was found. Also, 7 domain positions indicated the complete nucleotide sequence and are the part of the CMO gene naming, Rieske_RO_Alpha_CMO, RHO_alpha_C_CMO-like, Rieske, HcaE, anthran_1_2_A, PLN00095 and DUF260 was showed. Moreover, the result of phylogentic tress using all sequences of CMO gene showed that the CMO gene from oil palm variety Suratthani 2 was in the same group of date palm, barley, japonica rice and wild musa spp. Also, similar comparison of CMO amino acid within plant group showed the most similarity with oil palm amino acid in NCBI. In conclusion, this study found that full length of CMO gene from oil palm vareity Surat Thani 2 was different from the nucleotide sequences of oil palm in NCBI and Malaysia oil palm database. The different sequence was found at the translation end region that was not the domain. This CMO finding sequence will upload to NCBI database after submit the manuscript. Key words: glycine betaine, full length, phylogenetic tree
ปีเริ่มต้นงานวิจัย: 2557-10-01
ปีสิ้นสุดงานวิจัย: 2558-09-30
ลิขสิทธิ์: แสดงที่มา-ไม่ใช้เพื่อการค้า-ไม่ดัดแปลง 3.0 ประเทศไทย (CC BY-NC-ND 3.0 TH)
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

พจมาลย์ สุรนิลพงศ์, สุวิทย์ วุฒิสุทธิเมธาวี. "การแสดงออกของยีน choline monooxygenase (cmo) ในปาล์มน้ำมันThe expression of choline monooxygenase (cmo) in oil palm". มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์. 2558

พจมาลย์ สุรนิลพงศ์, สุวิทย์ วุฒิสุทธิเมธาวี. "การแสดงออกของยีน choline monooxygenase (cmo) ในปาล์มน้ำมันThe expression of choline monooxygenase (cmo) in oil palm". มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์. 2558. Print.



TARR Wordcloud:
การแสดงออกของยีน choline monooxygenase (cmo) ในปาล์มน้ำมัน
พจมาลย์ สุรนิลพงศ์ สุวิทย์ วุฒิสุทธิเมธาวี
มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์
30 กันยายน 2558
การโคลนและการศึกษาการแสดงออกขอยีน EgLEC1 สำหรับคัดเลือกปาล์มน้ำมันพันธุ์ดี การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่ 2 การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่3 การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่ 2 ปัจจัยต่างๆ ที่มีผลต่อการถ่ายยีนเข้าสู่ปาล์มน้ำมัน ศึกษา Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) ในโปรโมเตอร์ของยีน accD ในปาล์มน้ำมัน ปัจจัยต่างๆ ที่มีผลต่อการเพิ่มจำนวนโครโมโซมและการถ่ายยีนเข้าสู่ปาล์มน้ำมัน การปรับปรุงพันธุ์ปาล์มน้ำมันลูกผสมเทเนอรา (D x P) และการถ่ายทอดเทคโนโลยี การผลิตปาล์มน้ำมันที่เหมาะสมแก่เกษตรกร

แสดงที่มา-ไม่ใช้เพื่อการค้า-ไม่ดัดแปลง 3.0 ประเทศไทย (CC BY-NC-ND 3.0 TH)
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair