สืบค้นงานวิจัย
ความหลากหลายของเชื้อราวงศ์ Xylariaceae โดยศึกษายีนพอลีคีไทด์ซินเทส และ Internal Transcribed Spacers (ITSs)
ณัฎฐิกา สุวรรณาศรัย - มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ
ชื่อเรื่อง: ความหลากหลายของเชื้อราวงศ์ Xylariaceae โดยศึกษายีนพอลีคีไทด์ซินเทส และ Internal Transcribed Spacers (ITSs)
ชื่อเรื่อง (EN): Diversity of the Xylariaceous Fungi by Studying on Polyketide Synthase Genes and the Internal Transcribed Spacer (ITS) Regions
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ณัฎฐิกา สุวรรณาศรัย
บทคัดย่อ: ผลการสำรวจและเก็บรวบรวมตัวอย่างเชื้อรา Xyariaceae จำนวน 244 ตัวอย่าง ใน จ.พิษณุโลก ช่วงปี 2553 สามารถเพาะเลี้ยงเชื้อได้จำนวน 82 ตัวอย่าง (คิดเป็นร้อยละ 33.6) สามารถจัดจำแนกชนิด ตามลักษณะทางสัณฐานได้ 9 สกุล 61 ชนิด คือ Annulohypoxlon (8 ชนิด), Biscogniauxio (3 ชนิด), Camillea (1 ชนิด), Daldinia (1 ชนิด), Hypoxylon (19 ชนิด), Kretzschmaria (1 ชนิด), Rosellinia (1 ชนิด), Whalleya (1 ชนิด) และ Xylaria (26 ชนิด) ซึ่งในจำนวนนี้พบว่ามีเชื้อราถึง 14 ชนิด (คิดเป็น ร้อยละ 23) ที่ยังไม่สามารถระบุชนิดได้อย่างชัดเจน เนื่องจากความหลากหลายของลักษณะทางสัณฐาน และปัญหาในการระบุชนิดของเชื้อราบางสกุลที่ไม่มี onograph เป็นต้น ทั้งนี้ได้คัดเลือกตัวอย่างเชื้อราที่ ยากต่อการระบุชนิดจำนวน 35 ตัวอย่าง มาศึกษาหาลำดับนิวคลีโอไทด์บริเวณ internal transcribed spacers (TS) และเทียบเคียงกับฐานข้อมูล GenBank พบว่ามีตัวอย่างเชื้อราจำนวน 3 ตัวอย่าง (Annulohypoxylon sp. 1 (NS08255 และ NS08251) และ Hypoxylon sp. 4 (NS08116) ที่มีร้อยละ ความเหมือนต่ำกว่า 95 และมี ตัวอย่างที่มีร้อยละความเหมือนเท่ากับ 99 กับตัวอย่างเชื้อราที่ยังไม่ สามารถระบุชนิดได้ เมื่อวิเคราะห์ด้วยแผนภูมิวิวัฒนาการต้นไม้พบว่าข้อมูลของลำดับนิวคลิโอไทด์บริเวณ Tร สนับสนุนการแยกกลุ่มของเชื้อราที่ไม่สามารถระบุชนิดได้ออกจากเชื้อราชนิดอื่นในวงศ์ Xylariaceze ได้อย่างมีประสิทธิภาพ อย่างไรก็ตามเชื้อรากลุ่มนี้อาจเป็นเชื้อราชนิดใหม่ หรือชนิดแรกที่มีการศึกษาลำดับ นิวคลีโอไทด์ หรือเป็นรายงานการค้นพบครั้งแรกในประเทศไทย นอกจากนี้ยังได้คัดเลือกตัวแทนเชื้อรา จำนวน 22 ตัวอย่าง เพื่อตรวจหายีน polyketide synthases (PKS) บริเวณโดเมน beta-ketoacyl synthase (KS) พบว่าตัวอย่างเชื้อราส่วนใหญ่ที่สามารถเพิ่มจำนวนดีเอ็นเอบริเวณ Ks ได้ อยู่ในสกุล xylaria และผลของลำดับนิวคลีโอไทด์ของเชื้อ Xylaria มีความคล้ายคลึงกับ melanin synthases (non- reducing PKS) XIaria sp. BCC 1067 ในขณะที่ลำดับนิวคลีโอไทด์ของ KS ที่ได้จาก Annulohypoxylon และ Hypoxylon มีความคล้ายคลึงกับ polyketide synthases (Nodulisporium sp. ATCC74245) ตามลำดับ
บทคัดย่อ (EN): Two hundred and forty-four xylariaceous samples from Phitsanulok Province during year 2010 were collected and identified based on morphological characteristics. There were 9 genera and 61 species i.e. Annulohypoxlon (8 species), Biscogniauxia (3 species), Camillea (1 species), Daldinia (1 species), Hypoxylon (19 species), Kretzschmaria (1 species), Rosellinia (1 species), Whalleya (1 species) and Xylaria (26 species). In this study, over 14 species (or 23%) were noted as unidentified species due to the high diversity of their morphotypes and the lacking of monograph within some genera such as Xylaria. Then, the selected 35 xylariaceous samples were analysed on ITS regions and resulted clear separation from all known species in GenBank database. Three samples of Annulohypoxylon sp. (NS08255 and NS08251) and Hypoxylon sp. 4 (NS08116) exhibited low similarity less than 95% against known species in GenBank database whereas 9 samples exhibited high similarity up to 99% against unidentified species. Therefore, some samples found in this study trend to be new species based on their morphological and molecular characteristics. Moreover, the representatives of 22 samples were observed for polyketide synthase (PK) gene on beta-ketoacyl synthase (KS) domain and found that most samples achieved belonged to Xylaria, Annulohypoxylon and Hypoxylon respectively. The KS translated sequences results of Xylaria were similar to melanin synthases (non-reducing PKS) Xylaria sp. BCC1067, while Annulohypoxlon and Hypoxylon were similar to polyketide synthases (Nodulisporium sp. ATCC4245).
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ
คำสำคัญ: พอลีคีไทด์ซินเทส
คำสำคัญ (EN): Xylariaceae
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ณัฎฐิกา สุวรรณาศรัย. "ความหลากหลายของเชื้อราวงศ์ Xylariaceae โดยศึกษายีนพอลีคีไทด์ซินเทส และ Internal Transcribed Spacers (ITSs)Diversity of the Xylariaceous Fungi by Studying on Polyketide Synthase Genes and the Internal Transcribed Spacer (ITS) Regions". มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ. 2553

ณัฎฐิกา สุวรรณาศรัย. "ความหลากหลายของเชื้อราวงศ์ Xylariaceae โดยศึกษายีนพอลีคีไทด์ซินเทส และ Internal Transcribed Spacers (ITSs)Diversity of the Xylariaceous Fungi by Studying on Polyketide Synthase Genes and the Internal Transcribed Spacer (ITS) Regions". มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ. 2553. Print.



TARR Wordcloud:
ความหลากหลายของเชื้อราวงศ์ Xylariaceae โดยศึกษายีนพอลีคีไทด์ซินเทส และ Internal Transcribed Spacers (ITSs)
ณัฎฐิกา สุวรรณาศรัย
มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ
30 กันยายน 2553
การวิเคราะห์การทำงานของยีนที่ใช้ในการสังเคราะห์สารเคอร์คูมินอยด์ในขมิ้นชันโดย RNA interference ผลกระทบของสารเคมีป้องกันกำจัดเชื้อราที่มีต่อการเจริญและประสิทธิภาพของเชื้อรา Streptomyces-PR87 ความหลากหลายของเชื้อรา ascomycetes จากดินป่าไม้ในบริเวณเขื่อนสิรินธร และความสามารถในการผลิตเอนไซม์เซลลูเลส และไซลาเนส ความหลากหลายของเชื้อรา Hyphomycetes จากดินในพื้นที่อุทยานสัตว์ป่า จังหวัดอุบลราชธานี และการนำไปใช้ประโยชน์ด้านการเกษตร การคัดเลือกเชื้อรา Trichoderma spp. เพื่อใช้ในการควบคุมโรคใบร่วงของยางพาราที่เกิดจากเชื้อรา Phytophthore spp. และโรครากขาวที่เกิดจากเชื้อรา Rigidoporus lignosus การพอกเมล็ดพันธุ์ร่วมกับสารป้องกันเชื้อราเพื่อยับยั้งเชื้อรา Pythium spp. ในระยะต้นกล้าของยาสูบ การคัดเลือกและประสิทธิภาพของเชื้อรา Trichoderma spp. ในการป้องกันกำจัดโรครากเน่าโคนเน่าของส้มเกลี้ยง (Citrus sinensis) ที่เกิดจากเชื้อรา Phytophthora parasitica ปฏิกิริยาต่อต้านการเกิดโรคของใบและคัลลัสยางพาราต่ออิลิซิเตอร์ชนิดโพลีเปปไทด์ที่ผลิตโดยเชื้อรา Phytophthora palmivora ความหลากหลายของ pathotype ของเชื้อราสาเหตุโรคไหม้ข้าวในปี 2550/51 และยีนต้านทานกว้างขวางที่เป็นประโยชน์ในภาคเหนือตอนล่าง ความผันแปรของเชื้อราสาเหตุโรคใบจุดของยางพารา
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair