สืบค้นงานวิจัย
การพัฒนาเทคนิค loop-mediated isothermal amplification ร่วมกับเทคนิค lateral-flow dipsticks (LAMP-LFD)
Tongchai Nimitphak - มหาวิทยาลัยมหิดล
ชื่อเรื่อง: การพัฒนาเทคนิค loop-mediated isothermal amplification ร่วมกับเทคนิค lateral-flow dipsticks (LAMP-LFD)
ชื่อเรื่อง (EN): The development of loop-mediated isothermal amplification with lateral-flow dipsticks (LAMP-LFD) to detect infection of Hepatopancreatic parvovirus (HPV)
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Tongchai Nimitphak
บทคัดย่อ: Hepatopancreatic parvovirus หรือ HPV เป็นไวรัสที่มีสารพันธุกรรมเป็นดีเอ็นเอสายเดี่ยว ที่เป็นสาเหตุของโรคกุ้งแคระ ในปัจจุบันมีวิธีตรวจสอบไวรัสชนิดนี้หลายวิธี ได้แก่ PCR หรือ nested PCR ที่ตามด้วยการตรวจสอบผลโดยการแยกด้วยกระแสไฟฟ้าบนแผ่นเจลอะกาโรส เทคนิค PCR-ELISA เทคนิค real-time PCR เทคนิคการตรวจสอบทางภูมิคุ้มกัน และเทคนิคทางพยาธิวิทยา ของเนื้อเยื่อ ซึ่งเทคนิคเหล่านี้ล้วนมีข้อเสีย เช่น ราคาแพง ใช้เวลาในการตรวจนาน หรือใช้สารก่อ พิษ เทคนิค Loop-mediated isothermal amplification หรือ LAMP เป็นเทคนิคใหม่ที่รวดเร็ว ราคาถูก มีความไว และ ความจำเพาะสูงในการเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมภายใต้สภาวะอุณหภูมิเดียว การ รวมเทคนิค LAMP กับเทคนิค lateral-flow dipsticks หรือ LAMP-LFD เป็นการตรวจสอบผลผลิต LAMP โดยอาศัยหลักการของเทคนิคโครโมโตกราฟฟีแทนการแยกด้วยกระแสไฟฟ้า ทำให้สามารถ วิเคราะห์ผลได้ภายในเวลาเพียง 10 นาที การศึกษาเริ่มจากการออกแบบไพรเมอร์สำหรับปฏิกิริยา LAMP 4 ตัว จากส่วนของโปรตีน capsid ของไวรัส HPV ซึ่งสภาวะของปฏิกิริยา LAMP ที่ เหมาะสมคืออุณหภูมิ 63oC เป็นเวลา 1 ชั่วโมง ผลผลิต LAMP ที่ได้ถูกตรวจสอบด้วยเทคนิค LFD โดยการเติม DNA ติดตามที่เชื่อมติดกับ FITC ปริมาณ 20 pmole เมื่อทดสอบความไวในการตรวจ ด้วยเทคนิค LAMP-LFD โดยใช้พลาสมิดซึ่งมีลำดับเบสเป้าหมายที่ทราบจำนวนพบว่าเทคนิคนี้มี ความไวมากกว่าเทคนิค PCR 100 เท่า ซึ่งเทียบเท่ากับเทคนิค nested-PCR อย่างไรก็ตามเมื่อ ตรวจสอบกับ DNA ของตับกุ้งที่ติดเชื้อไวรัส HPV พบว่า LAMP-LFD มีความไวมากกว่า PCR 10 เท่า แต่น้อยกว่าชุดตรวจ nested-PCR 10 เท่า นอกจากนั้น LAMP-LFD ได้ให้ผลลบต่อ DNA ที่สกัด จากกุ้งปกติ และกุ้งที่ติดเชื้อไวรัสชนิดอื่นๆ เช่น monodon baculovirus หรือ MBV ไวรัสตัวแดงดวง ขาว หรือ WSSV และ ไวรัส infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus หรือ IHHNV
บทคัดย่อ (EN): Shrimp hepatopancreatic parvovirus (HPV) is a DNA virus that retards growth in cultivated shrimp. Present methods for its detection include normal or nested PCR followed by electophoresis, PCR-ELISA, real-time PCR, immunodetection and histological examination. These techniques entail various disadvantages such as high cost, long assay time or use of toxic substances. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a novel method for rapid, sensitive and specific pathogen detection via amplification of target nucleotide sequences under inexpensive isothermal conditions. Combining LAMP with amplicon detection by chromatographic lateral-flow dipsticks (LFD) instead of electrophoresis allows interpretation of results within 10 min. A set of four LAMP primers was designed from the capsid protein gene of HPV and LAMP conditions were optimized at 63oC for 1 h. The FITC-labeled DNA probe for the LFD test was optimized at 20 pmole. With a quantified plasmid template containing the LAMP target sequence, LAMPLFD was 100 times more sensitive than PCR-electrophoresis and equal to nested PCRelectrophoresis. With DNA extracts from HPV-infected shrimp, it was 10 times more sensitive than normal PCR-electrophoresis but 10 times less sensitive than a commercial kit for nested PCR-electroporesis. The LAMP-LFD method gave negative test results with DNA extracts from normal shrimp and from shrimp infected with other DNA viruses including monodon baculovirus (MBV), white spot syndrome virus (WSSV) and infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus (IHHNV).
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=126&RecId=5331&obj_id=4039
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Virus diseases
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยมหิดล
รายละเอียด: Hepatopancreatic parvovirus หรือ HPV เป็นไวรัสที่มีสารพันธุกรรมเป็นดีเอ็นเอสายเดี่ยว ที่เป็นสาเหตุของโรคกุ้งแคระ ในปัจจุบันมีวิธีตรวจสอบไวรัสชนิดนี้หลายวิธี ได้แก่ PCR หรือ nested PCR ที่ตามด้วยการตรวจสอบผลโดยการแยกด้วยกระแสไฟฟ้าบนแผ่นเจลอะกาโรส เทคนิค PCR-ELISA เทคนิค real-time PCR เทคนิคการตรวจสอบทางภูมิคุ้มกัน และเทคนิคทางพยาธิวิทยา ของเนื้อเยื่อ ซึ่งเทคนิคเหล่านี้ล้วนมีข้อเสีย เช่น ราคาแพง ใช้เวลาในการตรวจนาน หรือใช้สารก่อ พิษ เทคนิค Loop-mediated isothermal amplification หรือ LAMP เป็นเทคนิคใหม่ที่รวดเร็ว ราคาถูก มีความไว และ ความจำเพาะสูงในการเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมภายใต้สภาวะอุณหภูมิเดียว การ รวมเทคนิค LAMP กับเทคนิค lateral-flow dipsticks หรือ LAMP-LFD เป็นการตรวจสอบผลผลิต LAMP โดยอาศัยหลักการของเทคนิคโครโมโตกราฟฟีแทนการแยกด้วยกระแสไฟฟ้า ทำให้สามารถ วิเคราะห์ผลได้ภายในเวลาเพียง 10 นาที การศึกษาเริ่มจากการออกแบบไพรเมอร์สำหรับปฏิกิริยา LAMP 4 ตัว จากส่วนของโปรตีน capsid ของไวรัส HPV ซึ่งสภาวะของปฏิกิริยา LAMP ที่ เหมาะสมคืออุณหภูมิ 63oC เป็นเวลา 1 ชั่วโมง ผลผลิต LAMP ที่ได้ถูกตรวจสอบด้วยเทคนิค LFD โดยการเติม DNA ติดตามที่เชื่อมติดกับ FITC ปริมาณ 20 pmole เมื่อทดสอบความไวในการตรวจ ด้วยเทคนิค LAMP-LFD โดยใช้พลาสมิดซึ่งมีลำดับเบสเป้าหมายที่ทราบจำนวนพบว่าเทคนิคนี้มี ความไวมากกว่าเทคนิค PCR 100 เท่า ซึ่งเทียบเท่ากับเทคนิค nested-PCR อย่างไรก็ตามเมื่อ ตรวจสอบกับ DNA ของตับกุ้งที่ติดเชื้อไวรัส HPV พบว่า LAMP-LFD มีความไวมากกว่า PCR 10 เท่า แต่น้อยกว่าชุดตรวจ nested-PCR 10 เท่า นอกจากนั้น LAMP-LFD ได้ให้ผลลบต่อ DNA ที่สกัด จากกุ้งปกติ และกุ้งที่ติดเชื้อไวรัสชนิดอื่นๆ เช่น monodon baculovirus หรือ MBV ไวรัสตัวแดงดวง ขาว หรือ WSSV และ ไวรัส infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus หรือ IHHNV
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง


TARR Wordcloud:
การพัฒนาเทคนิค loop-mediated isothermal amplification ร่วมกับเทคนิค lateral-flow dipsticks (LAMP-LFD)
Tongchai Nimitphak
มหาวิทยาลัยมหิดล
2551
การพัฒนาเทคนิค loop-mediated isothermal amplification (LAMP) การพัฒนาเทคนิค loop-mediated isothermal amplification (LAMP) และเครื่องมือตรว การตรวจหาเชื้อ acanthamoeba keratitis ในตลับคอนแทคเลนส์โดยวิธี loop-mediated isothermal amplification method การพัฒนาเครื่องดื่มเคอร์คูมินเพื่อเป็นผลิตภัณฑ์เสริมอาหารโดยเทคนิคการเกิดไมเซลล์ การพัฒนาเทคนิคประหยัดเวลาในการวิเคราะห์และเครื่องวิเคราะห์การกระจายขนาดของอนุภาคโดยเทคนิคการตกตะกอน เทคนิคการยืดอายุการเก็บรักษาพริกหวานพร้อมบริโภคเพื่ออุตสาหกรรม การศึกษาความเป็นไปได้ในการลดความชื้นของข้าวเปลือกด้วยเทคนิคกระแสชน การกลั่นน้ำทะเลด้วยเทคนิคปั๊มฟอง ระบบแนะนำมือถือด้วยเทคนิค Collaborative Filtering ประสิทธิภาพทางเทคนิคของการผลิตข้าวโพดหวานในภาคเหนือของประเทศไทย
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก