สืบค้นงานวิจัย
Characterization of the biosynthetic gene cluster for cryptic phthoxazolin a in streptomyces avermitilis
Suroto D.A. - ไม่ระบุหน่วยงาน
ชื่อเรื่อง (EN): Characterization of the biosynthetic gene cluster for cryptic phthoxazolin a in streptomyces avermitilis
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Suroto D.A.
บทคัดย่อ (EN): Phthoxazolin A, an oxazole-containing polyketide, has a broad spectrum of anti-oomycete activity and herbicidal activity. We recently identified phthoxazolin A as a cryptic metabolite of Streptomyces avermitilis that produces the important anthelmintic agent avermectin. Even though genome data of S. avermitilis is publicly available, no plausible biosynthetic gene cluster for phthoxazolin A is apparent in the sequence data. Here, we identified and characterized the phthoxazolin A (ptx) biosynthetic gene cluster through genome sequencing, comparative genomic analysis, and gene disruption. Sequence analysis uncovered that the putative ptx biosynthetic genes are laid on an extra genomic region that is not found in the public database, and 8 open reading frames in the extra genomic region could be assigned roles in the biosynthesis of the oxazole ring, triene polyketide and carbamoyl moieties. Disruption of the ptxA gene encoding a discrete acyltransferase resulted in a complete loss of phthoxazolin A production, confirming that the trans-AT type I PKS system is responsible for the phthoxazolin A biosynthesis. Based on the predicted functional domains in the ptx assembly line, we propose the biosynthetic pathway of phthoxazolin A. © 2018 Suroto et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): en
เอกสารแนบ (EN): https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-85040347904&doi=10.1371%2fjournal.pone.0190973&partnerID=40&md5=fc28c384f26a5afa49585984ba5b3747
เผยแพร่โดย (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Streptomyces
เจ้าของลิขสิทธิ์ (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Suroto D.A.. "Characterization of the biosynthetic gene cluster for cryptic phthoxazolin a in streptomyces avermitilis". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.

Suroto D.A.. "Characterization of the biosynthetic gene cluster for cryptic phthoxazolin a in streptomyces avermitilis". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.. Print.



TARR Wordcloud:
Characterization of the biosynthetic gene cluster for cryptic phthoxazolin a in streptomyces avermitilis
Suroto D.A.
มหาวิทยาลัยมหิดล
ไม่ระบุวันที่เผยแพร่
Butenolides from Streptomyces albus J1074 act as external signals to stimulate avermectin production in Streptomyces avermitilis Molecular isolation and characterization of a spätzle gene from Macrobrachium rosenbergii Molecular cloning and characterization of a Toll receptor gene from Macrobrachium rosenbergii Gene expression and promoter characterization of heat-shock protein 90B gene (HSP90B) in the model unicellular green alga Chlamydomonas reinhardtii Horticultural characterization of a tetraploid transgenic plant of Tricyrtis sp. Carrying the gibberellin 2-oxidase gene Identification and Molecular Characterization of Multiple forms of â-1. 3-Glucanade Gene Promoter from Hevea brasiliensis through Inverse PCR MOLECULAR CHARACTERIZATION OF SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE (SERK) GENE FROM HEVEA BRASILIENSIS (MUELL. ARG.) (ภาษาอังกฤษ) Functional characterization of a novel C-type lectin gene in the black tiger shrimp, Penaeus monodon Functional Characterization of a Novel Hevea â-1, 3-Glucanase Gene Promoter and Its Regulatory Role in Hevea and Tobacco Tissues Identification and characterization of a crustacean female sex hormone in the giant freshwater prawn, Macrobrachium rosenbergii
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair