สืบค้นงานวิจัย
วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย
ศุภจิตรา ชัชวาลย์ - สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)
ชื่อเรื่อง: วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย
ชื่อเรื่อง (EN): Omics Science for Salt Tolerant Studies in Thai Rice (Oryza sativa L.)
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ศุภจิตรา ชัชวาลย์
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
บทคัดย่อ: สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน) หรือ สวก. ได้สนับสนุนทุนวิจัยโครงการ “วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย (ปีที่4)” แก่จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย โดยมีรองศาสตราจารย์ ดร.ศุภจิตรา ชัชวาล เป็นหัวหน้าโครงการ มีวัตถุประสงค์เพื่อระบุตำแหน่งของยีนที่เกี่ยวข้องกับความสามารถในการทนทานสภาวะเค็มในดินในข้าวไทยโดยวิธี genome-wide association study / metabolomics และสร้างเป็นฐานข้อมูลลักษณะทางสรีรวิทยาของการตอบสนองต่อความเค็ม และฐานข้อมูล SNP ทั้งจีโนมของข้าวไทย รวมทั้งระบุหน้าที่ของยีนที่น่าสนใจที่เกี่ยวข้องกับความสามารถในการต้านทานภาวะเค็มในข้าวไทย จากการศึกษาวิจัยพบว่า พืชสายพันธุ์กลาย cul3a-1, cul3a-2 and cul3a-3 มีลักษณะเหมือน wild type เมื่อเติบโตในภาวะปกติ แต่เมื่อเติบโตในภาวะเค็ม สายพันธุ์กลายทนเค็มได้น้อยกว่า wild type ซึ่งชี้ให้เห็นว่า AtCul3A มีความเกี่ยวข้องกับลักษณะทนเค็ม และเมื่อวิเคราะห์ทรานสคริปโทมเปรียบเทียบระหว่างทรานสคริปโทมของ wild type และของสายพันธุ์กลาย พบยีนที่มีการแสดงออกลดลงในสายพันธุ์กลายเป็นยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ด้วยแสง และการถ่ายทอดอิเล็กตรอนในกระบวนการหายใจระดับเซลล์ จากข้อมูลนี้ชี้ให้เห็นถึงบทบาทของ Cul3A ในการรักษากระบวนการทางเมแทบอลิซึมขณะที่ได้รับภาวะเค็ม โดยเฉพาะอย่างยิ่งการสังเคราะห์ด้วยแสงและการหายใจ และจากการวิเคราะห์ทรานสคริปโทมของข้าวพื้นเมืองไทยที่มีความสามารถในการทนเค็มที่แตกต่างกันในระยะออกดอก ได้แก่ พันธุ์ดอดอกไม้ (พันธุ์ทนเค็ม) นางนวล (พันธุ์ทนเค็ม) และตะเภาล่ม (พันธุ์ไม่ทนเค็ม) พบว่ามีมากกว่า 100 ยีนที่มีการแสดงออกแตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญ ในจำนวนดังกล่าวมียีนที่เป็น transcription factor หลายกลุ่มรวมอยู่ด้วย เช่น MYB, MYB-related, bZIP, ERF, GRAS, bHLH, GATA, M-type_MADS, CPP, WRKY และ FAR1 ในจำนวนนี้มี Transcription factor จำนวน 6 ชนิดที่พบในการวิเคราะห์ทรานสคริปโทมในระยะต้นกล้า ได้แก่ LOC_Os06g09370 (bHLH), LOC_Os07g43530 (bHLH), LOC_Os02g03960 (bZIP), LOC_Os03g08490 (ERF), LOC_Os07g37210 (MYB), และ LOC_Os05g09020 (WRKY) ซึ่งอยู่ 2 ชนิดที่มีรายงานว่าเกี่ยวข้องกับการตอบสนองต่อความเครียดอื่นๆ การวิเคราะห์ทรานสคริปโทมในระยะต้นกล้าพบว่า pyruvate dehydrogenase and pyruvate decarboxylase มีความเกี่ยวข้องกับลักษณะทนเค็ม การวิเคราะห์เมแทบอโลมพบว่า salicylic acid และ sinapoyl glucose มีส่วนที่ทำให้เกิดความทนเค็มในข้าว ซึ่งในงานวิจัยนี้ได้มีการพัฒนาจีโนมบราวเซอร์ ที่สามารถค้นหาสนิปส์ของข้าวพื้นเมืองไทยได้จากที่อยู่ IP 161.200.122.243 ประโยชน์ที่จะได้รับของโครงการนี้คือ สามารถนำข้อมูลที่ได้ไปใช้ในการคัดเลือกหรือปรับปรุงพันธุ์ข้าวที่ต้านทานภาวะเค็มได้ในอนาคต
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)
คำสำคัญ: แทบอโลมิกส์
คำสำคัญ (EN): Oryza sativa L.
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ศุภจิตรา ชัชวาลย์. "วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย Omics Science for Salt Tolerant Studies in Thai Rice (Oryza sativa L.)". สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน). 2558

ศุภจิตรา ชัชวาลย์. "วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย Omics Science for Salt Tolerant Studies in Thai Rice (Oryza sativa L.)". สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน). 2558. Print.



TARR Wordcloud:
วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย
ศุภจิตรา ชัชวาลย์
สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)
30 กันยายน 2558
วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย (ปีที่ 4) วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย (ปีที่4) วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย (ปีที่4) ผลการตอบสนองต่อความเครียดจากปฏิกิริยาออกซิเดชั่นที่เกิดจากความเค็มในสายพันธุ์ต่าง ๆ ของข้าวไทย วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการต้านทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการต้านทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย การศึกษาสภาพตลาดนัดโค กระบือ ในประเทศไทย วิทยาศาสตร์เชิงโอมิกส์เพื่อการศึกษาลักษณะการทนทานความเค็มในข้าว (Oryza sativa L.) ไทย
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair