สืบค้นงานวิจัย
ความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรปลาการ์ตูนอานม้า (Amphiprion polymnus) จากธรรมชาติและฟาร์มเพาะเลี้ยง
อรทัย มังคลาด - มหาวิทยาลัยบูรพา
ชื่อเรื่อง: ความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรปลาการ์ตูนอานม้า (Amphiprion polymnus) จากธรรมชาติและฟาร์มเพาะเลี้ยง
ชื่อเรื่อง (EN): Genetic Diversity of The Saddleblack anemonefish (Amphiprion polymnus) Populations from Nature and Farms
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: อรทัย มังคลาด
บทคัดย่อ: การศึกษาในครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรปลาการ์ตูนอานม้า (Amphiprion polymnus) และหาวิธีสกัดดีเอ็นเอที่เหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์ด้วยเทคนิคพีซีอาร์ต่อไป โดยเก็บตัวอย่างปลาการ์ตูนอานม้าจากแหล่งธรรมชาติ 1 แหล่ง คือ จ. ระยอง (NA) และจากฟาร์มเพาะเลี้ยง 4 แหล่ง คือจาก จ. ระยอง (RY) จ. ภูเก็ต (PU) จ. พังงา (PA) และ จ. ชลบุรี (CN) จำนวน 45, 10, 29, 52 และ 20 ตัวอย่าง ตามลำดับ การหาวิธีสกัดดีเอ็นเอที่เหมาะสมใช้ครีบหางของปลาการ์ตูนอานม้าที่เก็บรักษาแบบแช่แข็งและแช่ในเอทานอล 100% เปรียบเทียบวิธีสกัด 4 วิธี คือ 1) ชุดสกัด GF-1 tissue DNA extraction kit 2) PCR-ready genomic DNA 3) Chloroform 4) Guanidine Thiocyanate พบว่าการสกัดดีเอ็นเอด้วยวิธี (PCR-ready genomic DNA เป็นวิธีที่เหมาะสมมากกว่าวิธีอื่น คือ มีขั้นตอนสั้น ง่าย ใช้เนื้อเยื่อน้อย ไม่ใช้สารเคมีอันตราย และดีเอ็นเอที่สกัดได้สามารถนำไปเพิ่มปริมาณด้วยเทคนิคพีซีอาร์ จึงเหมาะสมสำหรับการศึกษาที่จำเป็นต้องใช้ตัวอย่างจำนวนมาก การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมภายในประชากรและระหว่างประชากรของปลาการ์ตูนอานม้า ทำการศึกษาในส่วนของยีน 16S rRNA, ND4-ND5 และ D-loop หรือ control region ซึ่งอยู่ในไมโทคอนเดรียและบริเวณ Internal Transcribed Spacer (ITS-1) ที่อยู่ในนิวเคลียสด้วยเทคนิค PCR-RFLP ผลการศึกษาพบว่าในส่วนของยีน 16S rRNA และ ND4-ND5 ไม่เหมาะสมที่จะนำมาใช้ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมในระดับประชากรในขณะที่บริเวณ D-loop ผลิตผลพีซีอาร์ของทุกตัวอย่างขนาดประมาณ 1,100 คู่เบส เมื่อนำมาตัดด้วยเอนไซม์ Msel, SspI, HpyCH4V, Asel และ Hpal รวมรูปแบบแถบดีเอ็นเอ (composite haplotype) ได้ทั้งสิ้นจำนวน 23 haplotypes สามารถแยกความแตกต่างระหว่างประชากรที่มาจากแหล่ง NA, RY และ CN ออกจากตัวอย่างที่มากจาก PU และ PA ได้อย่างชัดเจน การวิเคราะห์โครงสร้างประชากรด้วยวิธี AMOVA ในบริเวณ D-loop พบความแตกต่างทางพันธุกรรมอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติระหว่างประชากรแต่ละแหล่ง และมีความหลากหลายทางพันธุกรรมภายในกลุ่มประชากรสูง (percentage of variation = 49.17) แต่ละแหล่งมี่ค่า haplotype diversity เท่ากับ 0.75+-0.06, 0.53+-0.09, 0.73+-0.5, 0.40+-0.07 และ 0.67+-0.08 ตามลำดับ และมีค่า nucleotide diversity เท่ากับ 0.007, 0.007, 0.010, 0.006 และ 0.008 ตามลำดับ การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมในบริเวณ ITS-1 ซึ่งมีขนาดประมาณ 750 คู่ เบส เมื่อนำมาตัดด้วยเอนไซม์ HaeIII, HpaIII, MuII, HhaI และ Hinfl พบจำนวน composite haplotype ทั้งหมด 31 haplotypes สามารถแยกความแตกต่างระหว่างประชากรที่มาจากแต่ละแหล่งได้อย่างชัดเจน การวิเคราะห์โครงสร้างประชากรด้วยวิธี AMOVA ในบริเวณ ITS-1 พบความแตกต่างทางพันธุกรรมอย่างมีนัยสำคัญระหว่างประชากรแต่ละแห่ง และมีความหลากหลายทางพันธุกรรมภายในกลุ่มประชากรสูงมาก (percentage of variation = 84.60) แต่ละแหล่งมีค่า haplotype diversity (h+-SE) เท่ากับ 0.59+-0.07, 0.71+-0.11, 0.71+-0.04, 0.91+-0.01 และ 0.82+-0.05 ตามลำดับ และค่า nucleotide diversity เท่ากับ 0, 0, 0.004, 0.001 และ 0.001 ตามลำดับ จากการศึกษาสรุปได้ว่ากลุ่มประชากรของปลาการ์ตูนอานม้าจากฟาร์มเพาะเลี้ยง จ. ระยอง (RY) น่าจะมีแหล่งที่มาหรือมีสายบรรพบุรุษทางแม่เช่นเดียวกันกับปลาการ์ตูนอานม้าจากแหล่งธรรมชาติ จ. ระยอง (NA) ผลที่ได้จากการศึกษาในครั้งนี้จะเป็นพื้นฐานสำคัญสำหรับนำไปพัฒนาประยุกต์ใช้เพื่อการจัดการอนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติต่อไป
บทคัดย่อ (EN): 1) GF-1 tissue DNA extraction kit 2) PCR-ready genomic DNA 3) Chloroform and 4) Guanidine Thiocyanate, were then compared. The results indicated that the PCR-ready genomic DNA method was more suitable than others. This procedure is applicable to a large-scale study with a short protocol, technically easy, using small size of tissue and requires no potentially hazardous chemicals. In addition, the obtained DNA samples can be processed directly for PCR amplification. To analyze genetic diverstity within and among populations of the saddleback anemonefish, 3 mitochondrial DNA regions (16S rRNA, DA4-ND5 and D-loop or control region) and the nucllear Internal Transcribed Spacer (ITS-1) region were examined by PCR-RFLP. The results showed that 16S rRNA and ND4-ND5 regions were obviously not suitable for population diversity analysis. However, restriction analysis of the D-loop fragment (approximately 1,1000bp) obtained from all tested samples with Msel, SspI, HpyCH4V, Asel and HpaII gave 23 haplotypes in total. All composite haplotype were clearly differentiated populations between NA, RY an CN from PU and PA. Analysis of molecular variance measured by AMOVA showed highly significant genetic differentiation among populations and showed high percentage of variation within population (49.17). Analysis of genetic structure within population (NA, RY, PU, PA and CN) showed generally high haplotype diversity (h+-SE = 0.75+-0.06, 0.53+-0.09, 0.73+-0.5, 0.40+-0.07 and 0.67+-0.08, respectively) and nucleotide diversity Restriction analysis of the ITS-1 amplified PCR fragment (approximately 750 bp) with HaeIII, HpaII, MnII, Hhal and HinfI gave 31 composite haplotypes, which clearly distinguish between different populations. The AMOVA analysis inferred significant genetic differentiation among populations and revealed high percentage of variation within population (84.60). Analysis of genetic structure in each population (NA, RY, PU, PA and CN) showed high levels of haplotype diversity and nucleotide diversity. These results indicated that RY local fish farm population llikely to be the same population of the Rayong nutural population (RY) or they may come from the same maternal line. These results could be a basis for the development of suitable management strategies for conservation puposes.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยบูรพา
คำสำคัญ: พันธุกรรม
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยบูรพา
รายละเอียด: 1) GF-1 tissue DNA extraction kit 2) PCR-ready genomic DNA 3) Chloroform and 4) Guanidine Thiocyanate, were then compared. The results indicated that the PCR-ready genomic DNA method was more suitable than others. This procedure is applicable to a large-scale study with a short protocol, technically easy, using small size of tissue and requires no potentially hazardous chemicals. In addition, the obtained DNA samples can be processed directly for PCR amplification. To analyze genetic diverstity within and among populations of the saddleback anemonefish, 3 mitochondrial DNA regions (16S rRNA, DA4-ND5 and D-loop or control region) and the nucllear Internal Transcribed Spacer (ITS-1) region were examined by PCR-RFLP. The results showed that 16S rRNA and ND4-ND5 regions were obviously not suitable for population diversity analysis. However, restriction analysis of the D-loop fragment (approximately 1,1000bp) obtained from all tested samples with Msel, SspI, HpyCH4V, Asel and HpaII gave 23 haplotypes in total. All composite haplotype were clearly differentiated populations between NA, RY an CN from PU and PA. Analysis of molecular variance measured by AMOVA showed highly significant genetic differentiation among populations and showed high percentage of variation within population (49.17). Analysis of genetic structure within population (NA, RY, PU, PA and CN) showed generally high haplotype diversity (h+-SE = 0.75+-0.06, 0.53+-0.09, 0.73+-0.5, 0.40+-0.07 and 0.67+-0.08, respectively) and nucleotide diversity Restriction analysis of the ITS-1 amplified PCR fragment (approximately 750 bp) with HaeIII, HpaII, MnII, Hhal and HinfI gave 31 composite haplotypes, which clearly distinguish between different populations. The AMOVA analysis inferred significant genetic differentiation among populations and revealed high percentage of variation within population (84.60). Analysis of genetic structure in each population (NA, RY, PU, PA and CN) showed high levels of haplotype diversity and nucleotide diversity. These results indicated that RY local fish farm population llikely to be the same population of the Rayong nutural population (RY) or they may come from the same maternal line. These results could be a basis for the development of suitable management strategies for conservation puposes.
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

อรทัย มังคลาด. "ความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรปลาการ์ตูนอานม้า (Amphiprion polymnus) จากธรรมชาติและฟาร์มเพาะเลี้ยงGenetic Diversity of The Saddleblack anemonefish (Amphiprion polymnus) Populations from Nature and Farms". มหาวิทยาลัยบูรพา. 2553

อรทัย มังคลาด. "ความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรปลาการ์ตูนอานม้า (Amphiprion polymnus) จากธรรมชาติและฟาร์มเพาะเลี้ยงGenetic Diversity of The Saddleblack anemonefish (Amphiprion polymnus) Populations from Nature and Farms". มหาวิทยาลัยบูรพา. 2553. Print.



TARR Wordcloud:
ความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรปลาการ์ตูนอานม้า (Amphiprion polymnus) จากธรรมชาติและฟาร์มเพาะเลี้ยง
อรทัย มังคลาด
มหาวิทยาลัยบูรพา
2553
ผลของความเข้มข้นและระยะเวลาในการฉีดซ้ำของฮอร์โมนโกนาโดโทรปิน รีลีสซื่งฮอร์โมนอนาลอกซ์ (Gonadotropin Releasing Hormone Analogues) ชนิดออกฤทธิ์นามในรูปแบบไมโครสเฟียร์ต่อการวางไข่ของปลาการ์ตูนอานม้า Amph ผลจากการแพร่กระจายเมล็ดและการค่าเมล็ดโดยสัตว์และการรบกวนในธรรมชาติที่มีต่อการฟื้นตัวของประชากรต้น S ในกลุ่มประชากรไทย พื้นที่แห่งจินตนาการจากธรรมชาติ การเตรียมการด้านเศรษฐกิจก่อนเข้าสู่วัยสูงอายุของประชากรในพื้นที่เฝ้าระวังทางประชากรกาญจนบุรี การคัดเลือกพันธุ์ช่อดาว (Epimeredi indicus (L.) Rothm.) จากประชากรผสมเปิดเปรียบเทียบกับประชากรผสมตัวเอง ความหลากหลายของประชากรผีเสื้อกลางวัน ณ เส้นทางศึกษาธรรมชาติผากล้วยไม้-น้ำตกเหวสุวัตอุทยานแห่งชาติเขาใหญ่ ประเทศไทย ความสัมพันธ์ระหว่างพลวัตประชากรปูม้า Portunus pelagicus (Linnaeus, 1758) กับปัจจัยทางกายภาพของแหล่งหญ้าทะเล อ่าวคุ้งกระเบน จังหวัดจันทบุรี ผลของความร้อนต่อคุณสมบัติกายภาพของทับทิมธรรมชาติ การย้อมเซลล์ประสาทด้วยสีจากธรรมชาติ
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair