สืบค้นงานวิจัย
การค้นหา QTLs ที่ควบคุมลักษณะต้านทานต่อโรคเมล็ดด่างและโรคใบขีดโปร่งแสงในข้าวอย่างรวดเร็วด้วยวิธีการ QTL-seq และ GWAS ร่วมกับการค้นหาลำดับเบสดีเอ็นเอทั้งจีโนม
สามารถ วันชะนะ - สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ชื่อเรื่อง: การค้นหา QTLs ที่ควบคุมลักษณะต้านทานต่อโรคเมล็ดด่างและโรคใบขีดโปร่งแสงในข้าวอย่างรวดเร็วด้วยวิธีการ QTL-seq และ GWAS ร่วมกับการค้นหาลำดับเบสดีเอ็นเอทั้งจีโนม
ชื่อเรื่อง (EN): Rapid identification of QTLs for dirty panicle and bacterial leaf streak resistances in rice using QTL-seq and GWAS with whole-genome sequencing
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: สามารถ วันชะนะ
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
บทคัดย่อ: ข้าวเป็นสินค้าออกที่สำคัญของประเทศไทยและเป็นพืชอาหารหลักของเกือบครึ่งหนึ่งของประชากรโลก โดยเฉพาะประชากรแถบทวีปเอเชีย ได้มีการคาดการณ์ว่าปัญหาอันเนื่องมาจากการเพิ่มขึ้นของประชากรอย่างรวดเร็วจะส่งผลให้โลกประสบกับภาวะการณ์ขาดแคลนอาหารได้ในอนาคตอีกห้าสิบปีข้างหน้า ดังนั้นประเทศไทยในฐานะเป็นผู้ผลิตและผู้ส่งออกข้าวเป็นอันดับต้นๆ ของโลก จำเป็นต้องรักษาเสถียรภาพในการผลิตข้าวเพื่อให้เพียงพอสำหรับการบริโภคภายในประเทศและเพื่อการส่งออก แต่ปัญหาจากการเปลี่ยนแปลงของสภาพภูมิอากาศโลกในปัจจุบันทำให้การผลิตข้าวต้องประสบกับอุปสรรคหลายประการ โดยเฉพาะปัญหาเกี่ยวกับโรคและแมลงที่ทวีความรุนแรงมากขึ้น โรคข้าวที่สำคัญๆ หลายชนิดได้มีการศึกษาเชิงลึก จนสามารถพัฒนาพันธุ์ต้านทานขึ้นมาและได้มีการส่งเสริมให้เกษตรกรนำไปใช้เพาะปลูกอย่างกว้างขวางแล้ว อาทิเช่น ข้าวเหนียว กข6 ต้านทานโรคไหม้ &ldquo;ธัญสิริน&rdquo;, กข18 และข้าวเหนียว กข6 ต้านทานโรคไหม้และโรคขอบใบแห้ง &ldquo;TS2&rdquo; หรือ กข6 ต้นเตี้ย เป็นต้น แต่ยังมีโรคอีกหลายชนิดที่มีความสำคัญ เช่น โรคเมล็ดด่างจากเชื้อราและโรคใบขีดโปร่งแสงจากเชื้อแบคทีเรีย ซึ่งเป็นโรคที่มักจะถูกมองข้ามในอดีต เนื่องจากไม่พบการระบาดรุนแรง จึงไม่มีข้อมูลการศึกษาในเชิงลึกเกี่ยวกับโรคทั้งสองดังกล่าวมากนักในประเทศไทย แต่ปัจจุบันพบว่าเชื้อสาเหตุมีความรุนแรงมากขึ้น ทำให้เริ่มมีการแพร่ระบาดรุนแรงของโรคทั้งสอง และพบแพร่กระจายในแหล่งปลูกข้าวมากขึ้น โดยโรคเมล็ดด่างจะทำให้เมล็ดข้าวลีบเสียหาย และมีลักษณะเป็นรอยดำสกปรก รวมทั้งมีผลต่อคุณภาพเมล็ดข้าว เช่น เปอร์เซ็นต์การขัดสีที่ได้ต้นข้าว (head rice) น้อยลง ท้องไข่เพิ่มมากขึ้น เป็นต้น ส่วนโรคใบขีดโปร่งแสงจะทำให้ใบข้าวสูญเสียพื้นที่ในการสังเคราะห์แสง ซึ่งส่งผลโดยตรงต่อผลผลิตข้าว อีกทั้งข้าวพันธุ์แนะนำและพันธุ์ปรับปรุงที่เกษตรกรปลูกอยู่ในปัจจุบันล้วนอ่อนแอต่อโรคทั้งสองดังกล่าว ดังนั้นจึงมีความจำเป็นที่จะต้องป้องกันกำจัดโรคดังกล่าว ซึ่งวิธีการหนึ่งคือ การค้นหาพันธุ์ต้านทาน และทำการศึกษาในเชิงลึกเพื่อค้นหายีนต้านทาน สำหรับนำมาพัฒนาเป็นเครื่องหมายดีเอ็นเอ เพื่อใช้ในการคัดเลือกในการปรับปรุงพันธุ์ต้านทานโรคทั้งสองต่อไป โครงการนี้จึงมีจุดมุ่งหมายในการค้นหาตำแหน่ง QTLs ที่ควบคุมลักษณะต้านทานต่อโรคเมล็ดด่างและโรคใบขีดโปร่งแสงในข้าว โดยเลือกใช้วิธีการค้นหา QTL อย่างรวดเร็วด้วยเทคนิค QTL-seq ซึ่งเป็นวิธีการสมัยใหม่ที่ใช้ข้อมูลลำดับเบสของดีเอ็นเอทั้งจีโนมร่วมกับวิธีการ bulk-segregant analysis (BSA) ซึ่งสามารถดำเนินการได้อย่างรวดเร็ว โดยใช้ประชากรรุ่น F2 วิธีการดังกล่าวได้มีการใช้อย่างแพร่หลายในพืชปลูกหลายชนิดรวมทั้งข้าว นอกจากนี้ เพื่อให้สามารถค้นพบความหลากหลายของยีนต้านทานสำหรับลักษณะทั้งสองและเพื่อค้นหา QTLs ตำแหน่งอื่น ๆ ที่ไม่สามารถตรวจพบได้โดยวิธีการแรก จะอาศัยวิธีการวิเคราะห์ GWAS ในประชากรธรรมชาติ หลังจากค้นพบ QTLs แล้วจะทำการพัฒนาเครื่องหมายดีเอ็นเอที่จำเพาะกับแต่ละ QTL และนำมาประเมินความถูกต้องของ QTL (QTL validation) และทดสอบประสิทธิภาพของการใช้ marker-assisted selection (MAS) ในประชากรชั่วที่ BC2F2:3 เพื่อคัดเลือกเครื่องหมายดีเอ็นเอที่มีประสิทธิภาพมากที่สุด เพื่อใช้ในการคัดเลือกในการปรับปรุงพันธุ์ด้วยวิธี MAS ต่อไปในอนาคต</p>
บทคัดย่อ (EN): Rice is one of the most important exporting products of Thailand and a staple food of nearly half of the world&rsquo;s population, especially in Asian countries. According to the highly increasing world&rsquo;s population, it has been expected that the world might face to food security problem in the next 50 years. Thailand as a major world&rsquo;s rice exporter needs to maintain and sustain its rice production to meet the needs of internal consumptions as well as exporting. At present, the climate change problem is causing major impacts on rice production. These include the problem of pest and insect devastation. Several diseases i.e. blast and bacterial blight have been well studied and several resistant lines have been improved and used in rice breeding program. However, there are many other diseases that might cause a little effect on rice production in the past but recently can be more severe. These include the dirty panicle disease caused by fungi and leaf streak disease caused by bacteria. Since both dirty panicle and bacterial leaf streak diseases were not the major diseases in the past, they have usually been overlooked and not well studied in Thailand. However, they are now more important, since many areas of rice production has been found suffering from these diseases recently. The dirty panicle disease can highly reduce rice production since it directly affects on seed development during reproduction and bacterial leaf streak disease will destroy leaf area, hence, the rice yield will be dramatically reduced. Unfortunately, most of present recommended rice varieties are not resistant to both diseases. Therefore, it is time to find out resistant varieties and identify QTLs or genes controlling the traits in order to develop DNA markers for MAS breeding program. This project aims to rapidly identify QTLs responsible for the resistance of dirty panicle and bacterial leaf streak diseases using the approach called QTL-seq, which is new technology, combining whole-genome sequencing and bulk-segregant analysis methods. This approach can be done as early as in F2 generation and has been applied in several crops including rice. In addition, GWAS will be also applied in QTL identification using a natural population. After the QTLs have been discovered, a set of DNA markers specific to each QTL will be designed and validated in a segregating population (BC2F2:3) in order to select the best markers for dirty panicle and bacterial leaf streak diseases and use in MAS breeding program in the future.</p>
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
คำสำคัญ: ข้าว การปรับปรุงพันธุ์ เครื่องหมายดีเอ็นเอ โรคเมล็ดด่าง ใบขีดโปร่งแสง
คำสำคัญ (EN): GWAS
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

สามารถ วันชะนะ. "การค้นหา QTLs ที่ควบคุมลักษณะต้านทานต่อโรคเมล็ดด่างและโรคใบขีดโปร่งแสงในข้าวอย่างรวดเร็วด้วยวิธีการ QTL-seq และ GWAS ร่วมกับการค้นหาลำดับเบสดีเอ็นเอทั้งจีโนมRapid identification of QTLs for dirty panicle and bacterial leaf streak resistances in rice using QTL-seq and GWAS with whole-genome sequencing". สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. 2563

สามารถ วันชะนะ. "การค้นหา QTLs ที่ควบคุมลักษณะต้านทานต่อโรคเมล็ดด่างและโรคใบขีดโปร่งแสงในข้าวอย่างรวดเร็วด้วยวิธีการ QTL-seq และ GWAS ร่วมกับการค้นหาลำดับเบสดีเอ็นเอทั้งจีโนมRapid identification of QTLs for dirty panicle and bacterial leaf streak resistances in rice using QTL-seq and GWAS with whole-genome sequencing". สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. 2563. Print.



TARR Wordcloud:
การค้นหา QTLs ที่ควบคุมลักษณะต้านทานต่อโรคเมล็ดด่างและโรคใบขีดโปร่งแสงในข้าวอย่างรวดเร็วด้วยวิธีการ QTL-seq และ GWAS ร่วมกับการค้นหาลำดับเบสดีเอ็นเอทั้งจีโนม
สามารถ วันชะนะ
สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
2563
ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของเชื้อรา Curvularia lunata สาเหตุโรคเมล็ดด่างข้าวด้วย การวิเคราะห์ดีเอ็นเอบริเวณ ITS rDNA และเครื่องหมาย ISSR โครงการวิจัยและพัฒนาเพื่อแก้ปัญหาโรคใบขาวของอ้อย การวิเคราะห์ลำดับเบสยีน ITS2 และ psbA-trnH ในผักหวานป่า ผลของระยะปักดำต่อผลผลิตและการเป็นโรคจู๋ของข้าว การผลิต resistant starch จากแป้งข้าวด้วยวิธีการย่อยแป้งด้วยกรดร่วมกับการให้ความร้อนและความชื้น การจำแนกประชากรโรคไหม้ของข้าวโดยใช้ลายพิมพ์เอกลักษณ์ดีเอ็นเอในประเทศไทย ศึกษาชีววิธีในการควบคุมปริมาณจุลินทรีย์วิบริโอด้วยจุลินทรีย์บาซิลลัสในห้องปฏิบัติการ การคัดเลือกพันธุ์ข้าวต้านทานแล้งภายใต้สภาพอาศัยน้ำฝนในสาธารณรัฐประชาธิปไตยประชาชนลาว การศึกษาการระบาดของโรคเมล็ดด่างข้าวและการประเมินความต้านทานโรคบนข้าวพันธุ์ต่าง ๆ การพัฒนาเชื้อราไตรโคเดอร์มาปฏิปักษ์ที่ช่วยเพิ่มผลผลิตและลดโรคข้าวเป็นชีวภัณฑ์เชิงพาณิชย์
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair