สืบค้นงานวิจัย
การเปรียบเทียบการตรวจหาเชื้อเอชไอวีดื้อยาต้านไวรัสอินทีเกรสด้วยวิธี In-house HIV Genotype Assay และ Next Generation Sequencing Comparison of In-house HIV Integrase Genotype Assay and Next Generation Sequencing
ดนตร์ ช่างสม - 1 สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ 2 คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล มหาวิทยาลัยมหิดล 1 National Institute of Health, Department of Medical Sciences 2 Faculty of Medicine Siriraj Hospital Mahidol University
ชื่อเรื่อง: การเปรียบเทียบการตรวจหาเชื้อเอชไอวีดื้อยาต้านไวรัสอินทีเกรสด้วยวิธี In-house HIV Genotype Assay และ Next Generation Sequencing Comparison of In-house HIV Integrase Genotype Assay and Next Generation Sequencing
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ดนตร์ ช่างสม
บทคัดย่อ: ยาอินทีเกรสถูกนำมาใช้เป็นยาสูตรพื้นฐานใหม่สำหรับผู้ป่วยเอชไอวีของประเทศไทยตั้งแต่ปีพ.ศ. 2562 วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้เพื่อพัฒนาวิธีตรวจต่อยีนอินทีเกรสด้วยวิธี In-house (IH) Genotyping และนําผลมาเปรียบเทียบกับวิธี Next Generation Sequencing (NGS) ผลการศึกษาพบว่าวิธีที่พัฒนาขึ้นมีความไวและความจําเพาะได้ผลดีไม่ต่ำกว่าเกณฑ์ของ WHO ในเรื่องการประเมินวิธีตรวจที่พัฒนาขึ้น นอกจากนั้นยังสามารถตรวจตัวอย่างเชี้อเอชไอวีสายพันธุ์อื่น ได้แก่ A B C D และ F จำนวนทั้งหมด 25 ตัวอย่างได้การเปรียบเทียบวิธี IH กับวิธี NGS ในตัวอย่างสองกล่มคือกลุ่มผู้ป่วยก่อนรับยาจำนวน 24 ตัวอย่าง โดยพบสายพันธุ์ CRF01_AE 23 ตัวอย่าง (96%) และ B 1 ตัวอย่าง (4%) และกลุ่มผู้ป่วยสงสัยดื้อยาต้านไวรัสเอชไอวีชนิดอื่นจำนวน 10 ตัวอย่างเป็น CRF01_AE ทั้งหมดพบว่าทั้งสองวิธีให้ผลสอดคล้องในระดับนิวคลิโอไทด์โดยเฉลี่ยที่ร้อยละ 98.8 และ 98.5 ในตัวอย่างกลุ่มแรกและกลุ่มที่สองตามลำดับแต่เนื่องจากเป็นยาชนิดใหม่ที่ข้อมูลนิวคลีโอไทด์และการกลายพันธุ์ ในตำแหน่งต่างๆ เป็นสายพันธุ์เอชไอวีในประเทศไทยจะถูกนำไปเปรียบเทียบกับฐานข้อมูลทั่วโลกเพื่อสร้างเป็นฐานข้อมูลสำหรับเชื้อเอชไอวีในประเทศไทยต่อไป Integrase strand transfer inhibitors (INSTI) has been recommended as new first-line antiretroviral treatment for HIV patients in Thailand in 2019. The objectives of this study were to develop the in-house HIV integrase genotype assay (IH) and to compare the results from IH and Next Generation Sequencing (NGS). The assay has high efficiency according to the validation recommendations for in-house assay by WHO. The IH could detect in all 25 samples (100%), which were other HIV subtypes including subtype A, B, C, D, and F. Two groups of HIV patients including 24 samples from pretreatment patients (PDR), which 23 samples were CRF01_AE (96%) and 1 sample was subtype B (4 %), and 10 samples from the acquired drug resistance patients (ADR) who has exposed to other antiretroviral treatment. The average nucleotide sequence identities between IH and NGS from PDR and ADR groups were 98.8 % and 98.5 %, respectively. The nucleotide sequences information and the INTSI resistance mutations collected from the HIV-1 subtype in Thailand were compared with the mutations reported from worldwide databases. The data will be used for establish the INTSI resistance mutations database for HIV-1 in this country
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://nih.dmsc.moph.go.th/research/showimgdetil.php?id=732
เผยแพร่โดย: 1 สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ 2 คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล มหาวิทยาลัยมหิดล 1 National Institute of Health, Department of Medical Sciences 2 Faculty of Medicine Siriraj Hospital Mahidol University
คำสำคัญ: Next generation sequencing
เจ้าของลิขสิทธิ์: สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุขกรมวิทยาศาสตร์การแพทย์
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง


TARR Wordcloud:
การเปรียบเทียบการตรวจหาเชื้อเอชไอวีดื้อยาต้านไวรัสอินทีเกรสด้วยวิธี In-house HIV Genotype Assay และ Next Generation Sequencing Comparison of In-house HIV Integrase Genotype Assay and Next Generation Sequencing
1 สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ 2 คณะแพทยศาสตร์ศิริราชพยาบาล มหาวิทยาลัยมหิดล 1 National Institute of Health, Department of Medical Sciences 2 Faculty of Medicine Siriraj Hospital Mahidol University
2563
การพัฒนาการตรวจหา เชื้อสเตรปโตคอคคัส ซูอิส และยีนที่จำเพาะต่อ ซีโรไทป์โดยใช้เทคนิค multiplex PCR การพัฒนาวิธีตรวจหาเชื้อ Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis ในสัตว์เคี้ยวเอื้อง ด้วยเทคนิคอณูชีวโมเลกุล การตรวจหาเชื้อแบคทีเรียในจีนัส Enterococcus ที่ดื้อต่อยา vancomycin ในสุกร Prevalence and genotype of Giardia duodenalis of asymptomatic individual in a child care center, Bangkok, Thailand พัฒนาชุดตรวจสอบไวรัสอย่างง่ายและเทคนิคการผลิตกล้วยไม้ปลอดไวรัส พัฒนาชุดตรวจสอบไวรัสอย่างง่ายและเทคนิคการผลิตกล้วยไม้ปลอดไวรัส การตรวจเชื้อไวรัส BHV-1 ด้วยเทคนิค Nested PCR การพัฒนา recombinant 3ABC-based ELISA เพื่อวินิจฉัยสัตว์ที่ติดเชื้อไวรัสโรคปากและเท้าเปื่อยออกจากสัตว์ที่ได้รับวัคซีน การพัฒนา recombinant 3ABC-based ELISA เพื่อวินิจฉัยสัตว์ที่ติดเชื้อไวรัสโรคปากและเท้าเปื่อยออกจากสัตว์ที่ได้รับวัคซีน GLIFT Kit เพื่อการตรวจสอบเชื้อ Potato Virus Y ในมันฝรั่ง
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก